Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms