Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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