Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms