Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms