Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 642.8 ms