Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PALD1Q9ULE6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALD1Q9ULE6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms