Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms