Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM53CQ9NYF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM53CQ9NYF3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms