Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB4Q9NTQ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms