Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A2Q9NTI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A2Q9NTI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms