Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LTBP3Q9NS15 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LTBP3Q9NS15 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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