Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN4Q9NQC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN4Q9NQC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms