Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB18Q9NP72 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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