Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LY9Q9HBG7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LY9Q9HBG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms