Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A2Q9HAB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC52A2Q9HAB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms