Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCQ9H7C4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCQ9H7C4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms