Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRABDQ9H4I3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms