Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZHX3Q9H4I2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZHX3Q9H4I2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZHX3Q9H4I2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms