Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MTIF3Q9H2K0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTIF3Q9H2K0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms