Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms