Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF4Q9BXJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms