Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA16Q9BXB7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA16Q9BXB7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA16Q9BXB7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA16Q9BXB7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms