Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL15Q96M94 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL15Q96M94 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms