Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMI2Q96E14 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMI2Q96E14 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RMI2Q96E14 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RMI2Q96E14 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RMI2Q96E14 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RMI2Q96E14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RMI2Q96E14 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RMI2Q96E14 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RMI2Q96E14 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RMI2Q96E14 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RMI2Q96E14 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RMI2Q96E14 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms