Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms