Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIFAP3Q92845 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms