Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM69Q86WT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms