Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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