Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREML4Q6UXN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREML4Q6UXN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms