Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms