Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEPROQ6NW34 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms