Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3HQ6NTF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3HQ6NTF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms