Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5B0

LCE3E, Late cornified envelope protein 3E, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3EQ5T5B0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms