Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms