Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HABP4Q5JVS0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms