Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR44Q5JSH3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
WDR44Q5JSH3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR44Q5JSH3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms