Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF628Q5EBL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF628Q5EBL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF628Q5EBL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms