Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LACTB2Q53H82 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LACTB2Q53H82 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LACTB2Q53H82 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms