Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HFEQ30201 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HFEQ30201 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HFEQ30201 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HFEQ30201 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HFEQ30201 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HFEQ30201 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HFEQ30201 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HFEQ30201 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms