Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms