Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM187BQ17R55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM187BQ17R55 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM187BQ17R55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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