Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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