Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ALX1Q15699 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
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