Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO1Q147U7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO1Q147U7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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