Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBR1Q14596 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBR1Q14596 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms