Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A2Q14055 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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