Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFCP2Q12800 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFCP2Q12800 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFCP2Q12800 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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