Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms