Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF4Q08170 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF4Q08170 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms