Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD164Q04900 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CD164Q04900 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD164Q04900 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CD164Q04900 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD164Q04900 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms